В статье рассматривается проблема учета почвенного плодородия, при мониторинге земель сельскохозяйственного назначения, на фоне проявляющихся деградационных процессов. В связи с недостаточным разграничением понятий «земля» и «почва» специфика наблюдений за ними, приводит к сложностям в учете изменений их качественных и количественных показателей, что вызывало необходимость исследований. Деградация почв проявляется в их дегумификации, эрозии, загрязнении, что в конечном итоге приводит к снижению производственной ценности земель. Убытки от деградации, в том числе и техногенной, в период 1978-2016 гг. составил 8,44 млрд. руб. В связи с чем, рассмотрены динамика структуры земельного фонда, гумусовое состояние почв, наличие элементов питания и содержание тяжелых металлов в почвах. Динамика содержания гумуса в почвах Азово-Кубанской низменности показала тенденцию его снижения с 3,9 % до 3,7 %, с достаточно высокими величинами достоверности аппроксимации ( = 0,6 – 0,9). Дана оценка производственной ценности почв Тимашевского района, которая показала, что при использовании показателя «нормативной» урожайности проявляется большая дифференцированность между почвами лучшего и худшего качества. Приведена динамика содержания тяжелых металлов в почвах по двум наиболее распространенным агроландшафтам Краснодарского края. Сделан вывод о том, что мониторинг земель сельскохозяйственного назначения может и должен стать источником информации о состоянии и использовании почв. Отсутствие материалов сплошного почвенного обследования предлагается восполнить данными, полученными в процессе мониторинга земель сельскохозяйственного назначения.